潘君骅1930年10月出生于上海市。1960年毕业于苏联科学院列宁格勒普尔科沃天文台，获副博士学位。1999年当选中国工程院院士。
据《光明日报》报道，1956年，潘君骅接受单位安排到苏联留学，师从苏联著名天文光学专家马克苏托夫。由于潘君骅本科学的是机械，光学只是业余水平，所以他学习更加刻苦。第一年，要求研究生完成哲学、俄语和两门专业课共四门课程，其中哲学和俄语都要到城里的苏联科学院院部去上课，每周两三次。经过努力，他的四门课程都得了满分。
“总想着不能给国家丢脸，回国后能够学以致用。”潘君骅说。
1960年8月，潘君骅回到长春光机所，立即参与到了60厘米中间试验望远镜的研制中，为216工程的设计方案积累了宝贵经验。
1975年，中国科学院再次启动2.16米口径的大型望远镜研制任务，并成立了216工程领导小组，潘君骅担任技术总体组组长。“困难不怕，怕的是没有求真务实的态度。”潘君骅说。凭着他严谨、细致、踏实的科研精神，项目中出现的几百个大大小小的问题，都得以妥善解决。
2.16米光学天文望远镜是我国自行研制的、当时远东地区口径最大的光学望远镜，被誉为中国天文学界的“一座丰碑”，该项目获1998年国家科技进步一等奖。
“在应用光学领域，光学设计、检验、加工密不可分，三者沟通好，好多技术问题容易解决。不管侧重于哪方面做研究，对这三个方面都要有所了解。”潘君骅经常这样对学生们说。
“推公式不是科研的全部，必须动手去试。”潘君骅说。
2019年，一颗国际编号为216331的小行星，获国际小行星中心和国际小行星命名委员会批准，被正式命名为“潘君骅星”，以表彰潘君骅长期以来在应用光学研究领域做出的巨大贡献。
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