胡懿娟的研究主要集中开发用于生物医学领域复杂组学数据的统计理论和方法。她曾在包括美国《国家科学院院刊》在内的许多著名期刊上发表过论文，是BMC Bioinformatics和Statistics in Biosciences等生信领域顶尖期刊的副编，也是多个国际学术协会的成员。去年11月，北大BICMR在微信公众号上发布针对胡懿娟的“新入职教师访谈”。谈及选择来到北大BICMR工作的原因，胡懿娟表示，BICMR是一个极高的平台，在全国数学相关领域中具有引领作用。在这里还能接触到中国一流的本科生和研究生，这不仅能极大地推动她的研究工作，也让她欣喜于能够参与培养中国最优秀的年轻人才。
2018年，美国特朗普政府启动“中国行动计划”，宣称旨在调查被认为威胁美国国家安全的商业机密窃取和经济间谍活动，此举广受诟病，被指控冻结了正常学术合作，助长了反亚裔种族偏见。尽管拜登政府上台后于2022年终止了该计划，但其造成的寒蝉效应仍然笼罩着学术界，不少在美生活工作多年的华裔学者因此回到中国。去年7月，美国斯坦福大学中国经济与制度研究中心公布的研究结果显示，离开美国的在华出生科学家人数正逐渐增加，从2010年的900人上升到2021年的2621人。PNAS上刊登的一项调查称，在美国实施“中国行动计划”三年多后，超过三分之一的美国华裔科学家感到不受欢迎，72%觉得不安全，约70%因调查担惊受怕。
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