新冠疫情中，备受关注的是，他带领团队成功研发上市全球首款新冠灭活疫苗。该疫苗上市一周年之际，即2021年12月9日，就已获得10个国家注册上市，112个国家、地区批准使用，当时也成为获批国家数最多、供应范围最广、接种量最大的新冠疫苗。
2023年11月3日，杨晓明荣获第十一届中国免疫学会“杰出学者奖”。
彼时，他在大会主会场作新发传染病防控技术和展望的报告。
报告指出，新突发传染病需要迅速布局诊断、治疗和预防全方位疫情防控攻关策略。
中国生物在疫苗株选育、细胞培养、病毒灭活及评价、大规模纯化、生物安全以及临床研究等方面实现重大技术系统性突破，建立了拥有自主知识产权、快速、高效、覆盖全工艺链条、领先国际的新型病毒灭活疫苗技术体系。
“以身试药”接种新冠疫苗
去年底还曾公开露面
据新华每日电讯此前报道，杨晓明曾在2021年接受专访时表示，此次中国生物的新冠疫苗从立项获批到研发、上市，总计用了330多天的时间，从科学的角度看，可以说前所未有的短。
从全球经验看，过去一种疫苗从研发到上市，一般需要10年以上，投入10个亿以上。
速度快一些的，也需要5年到6年时间。
所以，新冠疫苗330多天能够上市，我们可以说是一个奇迹。
杨晓明在接受采访时表示，“我是去年3月23日最早接种我们研发疫苗的人，作为最早一批‘以身试药’者，接种新冠灭活疫苗后没有任何异常情况，就是打针的地方稍微疼一点。因为接种后要定期检测抗体，我在9个月时间里已经被抽了约60管血。打第一针后的第二个星期就能检测到抗体，打第二针后2周左右就能检测出较高的抗体水平。‘以身试药’就是一个传统。新冠灭活疫苗临床试验中，累计有几万名入组受试者接种疫苗，其中很多是生物制品人。中国生物人有句话：做敢给自己家人打的疫苗。这是我们的追求，也是我们的自信。”
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